[소기업 퇴사자 처리 ⑨] 원천징수영수증 교부·지급 명세서 제출(퇴사자 처리 마무리)

원천징수영수증 교부

4대보험 상실신고까지 끝냈다고 다 된게 아니다.
퇴사자에게 서류를 줘야 하고, 국세청에도 별도 제출이 남아있다.
이것까지 끝내야 퇴사자 처리가 진짜 마무리된다.

 

1. 마지막으로 해야하는 업무 4가지

소기업에서 가장 많이 누락되는 업무이다.

업무	대상	기한
근로소득 원천징수영수증 교부	퇴사자에게 교부	퇴사즉시(최종 급여지급 후)
퇴직소득 원천징수영수증 교부	퇴사자에게 교부	퇴직금 지급 후 즉시
근로소득 지급명세서 제출	홈택스 제출	다음 해 3월 10일
퇴직소득 지급명세서 제출	홈택스 제출	다음 해 3월 10일

 

2. 근로소득 원천징수영수증 교부

📌 소득세법 제143조 제3항
"원천징수의무자는 퇴직하는 자에게 퇴직하는 달의 근로소득을 지급할 때에는 원천징수영수증을 즉시 발급하여야 한다."

퇴사자가 다음 해 5월 종합소득세 신고 또는 새 직장 연말정산 시 반드시 필요한 서류다.

 

🟣 홈택스(http://www.hometax.go.kr) → 사업자 로그인
🟣 [신고/납부] → [원천세] → [근로소득 지급명세서 제출/내역조회]
🟣 해당 퇴사자 검색 → [원천징수영수증 출력] 클릭
🟣 PDF 저장 후 퇴사자 이메일로 즉시 발송

 

📋 영수증 기재 필수 항목 확인

• 근무기간
• 총급여액 및 비과세 소득
• 소득공제 항목별 금액
• 결정세액 및 기납부세액
• 차감 징수세액(환급 또는 추가납부)

💡 퇴사자 개인 이메일을 미리 받아두면 퇴사 처리 완료 후 즉시 발송할 수 있다.

 

3. 퇴직소득 원천징수영수증 교부

📌 소득세법 제145조의3

"원천징수의무자는 퇴직소득을 지급할 때 원천징수영수증을 해당 퇴직자에게 발급하여야 한다."

퇴직금을 IRP로 이전할 때 금융기관에서 요청하는 경우도 있다. 발급하지 않으면 퇴사자가 세금 신고 시 불이익이 생길 수 있다.

 

🟣 홈택스 → 사업자 로그인
🟣 [신고/납부] → [원천세] → [퇴직소득 지급명세서 제출/내역조회]
🟣 해당 퇴사자 검색 → [원천징수영수증 출력] 클릭
🟣 PDF 저장 후 퇴사자에게 발송

 

📋 영수증 기재 필수 항목 확인

• 근무기간
• 근속연수
• 퇴직급여 총액
• 비과세 소득
• 근속연수공제, 환산급여공제 금액
• 퇴직소득 결정세액 및 징수세액

4. 근로소득 지급명세서 제출

📌 소득세법 제164조 제1항
"원천징수의무자는 근로소득의 지급명세서를 해당 과세기간의 다음 연도 3월 10일까지 원천징수 관할 세무서장에게 제출하여야 한다."

미제출하거나 불분명하게 제출하면 지급금액의 1%를 결정세액에 가산해 징수한다.

제출 기한: 퇴직일이 속한 과세기간의 다음 해 3월 10일

💡 수시 제출도 가능하다.
중도퇴사자의 지급명세서 수시 제출은 8월 이후부터 홈택스에서 가능하다. 수시 제출 시 기본정보 입력 단계에서 수시(월별)분할제출을 선택한다.

 

홈택스 근로소득 지급명세서 제출 단계별 방법

🟣 STEP 1. 홈택스 접속 및 메뉴 진입
홈택스(http://www.hometax.go.kr) → 사업자 로그인

홈택스 → [신청/제출] → [(근로·사업 등) 지급명세서] → [근로소득 지급명세서 제출/내역조회] MOEL

🟣 STEP 2. 제출 방식 선택

방식	내용	적합 대상
직접작성 제출	홈택스 화면에서 직접 입력	퇴사자 1~2명
변환 제출	엑셀 파일 업로드	퇴사자 다수

💡 소기업 단일 퇴사자라면 직접작성 제출이 가장 편리하다.

🟣 STEP 3. 원천징수의무자 기본사항 입력
사업자등록번호 → 자동 불러오기
귀속연도 입력 (퇴사 연도)
제출 구분: 정기제출 또는 수시제출 선택
[저장 후 다음이동] 클릭


🟣 STEP 4. 소득자 인적사항 입력
퇴사자 성명·주민등록번호 입력
근무기간: 입사일 ~ 퇴직일
내·외국인 구분
[저장 후 다음이동] 클릭

 

🟣 STEP 5. 소득·세액공제 명세 입력
소득, 세액공제 명세 작성 클릭 → 소득자와의 관계 등 해당 항목 선택 후 재직 기간 중 건강·고용보험료 합계액을 입력 후 등록하기

입력 항목	내용
총급여액	비과세 포함 전체 급여
비과세 소득	식대, 차량보조금 등
근로소득공제	자동 계산
인적공제	본인 및 부양가족
건강·고용보험료	재직 기간 납입 합계
결정세액	중도퇴사 연말정산 결과
기납부세액	매월 원천징수 합계

 

🟣 STEP 6. 최종 확인 및 제출

입력 내용 전체 검토
[지급명세서 제출하기] 클릭
접수번호 확인 및 저장

💡 제출 완료 후 홈택스 → [My 홈택스] → [지급명세서·원천징수영수증 내역]에서 제출 여부 확인 가능하다.

 

5. 퇴직소득 지급명세서 제출

📌 소득세법 제164조 제1항
"퇴직소득 지급명세서는 해당 과세기간의 다음 연도 3월 10일까지 제출하여야 한다."

제출 기한: 퇴직일이 속한 과세기간의 다음 해 3월 10일

 

홈택스 퇴직소득 지급명세서 제출 단계별 방법
🟣 홈택스 → 사업자 로그인
🟣 [신청/제출] → [(근로·사업 등) 지급명세서] → [퇴직소득 지급명세서 제출/내역조회]
🟣 [직접작성 제출방식] 선택
🟣 원천징수의무자 기본사항 입력

• 사업자등록번호 → 자동 불러오기
• 귀속연도·지급연도 입력
• [저장 후 다음이동] 클릭

🟣 소득자 인적사항 및 퇴직소득 명세 입력

 

입력 항목	내용
퇴사자 정보	성명, 주민등록번호
근무기간	입사일 ~ 퇴직일(마지막근무일)
근속연수	올림처리
퇴직급여 총액	IRP 입금액(세전)
비과세 퇴직소득	해당 없으면 0입력
근속연수공제	자동 계산
환산급여	자동 계산
퇴직소득 결정세액	원천징수한 세액

 

🟣 [지급명세서 제출하기] 클릭 → 접수번호 확인

 

6. 퇴사자에게 안내해야 할 내용 정리

① 원천징수영수증 용도 안내

• 새 직장 연말정산시 제출 필요
• 다음해 5월 종합소득세 신고시 필요
• 금융기관, 관공서 제출용

② 종합소득세 신고 안내

• 미적용 공제 항목은 다음 해 5월 본인이 직접 신고해서 추가 환급 가능
• 근로소득 외 다른 소득이 있으면 합산 신고 필요

③ 실업급여 신청 안내(해당자)

• 이직확인서 발급 완료 여부 확인
• 고용센터 또는 고용24에서 실업급여 신청 가능
• 자진퇴사의 경우 원칙적으로 실업급여 불가 안내

④ 건강보험 지역가입자 전환 안내

• 퇴직 후 직장보험 자격 상실
• 지역가입자로 전환되거나 피부양자로 등재 가능
• 국민건강보험공단(1577-1000) 문의

7. 퇴사자 처리 최종 체크리스트

순서	업무	기한
1	사직서 수리 및 퇴직일 확정	즉시
2	통상임금, 평균임금 계산	즉시
3	미사용 연차수당 계산, 지급	퇴사월 급여일
4	퇴직월 급여 일할계산, 지급	퇴사월 급여일
5	퇴직급 계산 및 IRP 이전	14일 이내
6	퇴직소득세 계산 및 원천징수	퇴직금 지급 시
7	중도퇴사자 연말정산	퇴사월 급여일
8	홈택스 원천세 신고	익월 10일
9	위택스 지방소득세 신고	익월 10일
10	고용보험 이직확인서 제출	상실신고와 동시
11	4대보험 상실신고	익월 15일
12	원천징수영수증 교부(근로+퇴직)	즉시
13	근로소득 지급명세서 제출
14	퇴직소득 지급명세서 제출

 

⚠️ 흔히 하는 실수 1가지
원천세 신고를 했으니 지급명세서 제출도 된 것으로 착각하는 것이다. 원천세 신고(익월 10일)와 지급명세서 제출(익년 3월 10일)은 완전히 다른 업무다. 
원천세 신고만 하고 지급명세서를 빠뜨리면 지급금액의 1% 가산세가 자동 부과된다.
퇴사자가 발생할 때마다 다음 해 3월 달력에 미리 등록해두는 습관을 들이는 게 가장 확실한 방법이다.

 

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이 글로 소기업 퇴사자 처리 시리즈가 완결됐다.
이 시리즈 전체를 저장해두고 퇴사자 발생할 때마다 꺼내 쓰시길 바란다.
처리 과정에서 막히는 부분이 있으면 댓글로 남겨 주시면 아는 범위 내에서 답변드리겠다! 😊
⚠️ 본 글은 일반 정보 제공 목적으로 작성됐다. 구체적인 사안은 세무사·노무사 또는 국세청 홈택스 전자신고 도움 서비스를 활용하길 권장한다.

📚 소기업 퇴사자 처리 시리즈 전체 링크

2026.05.18 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 인사담당자 필독] 퇴사자 발생 시 처리 순서 총정리(2026년 체크리스트)

2026.05.19 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ②] 통상임금·평균임금 계산 방법 (퇴직금 계산의 기초)

2026.05.20 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ③] 퇴직금 계산 방법 및 지급 기한 (2026년 기준)

2026.05.22 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ④] 퇴직소득세 계산 및 원천징수 방법 (2026년 기준)

2026.06.01 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ⑤] 중도퇴사자 연말정산 방법(홈택스 원천세 신고까지)

2026.06.09 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ⑥] 위택스 지방소득세 신고 및 환급 방법 (2026년 6월 기준)

2026.06.10 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ⑦] 미사용 연차수당 계산법 및 지급 기한 (2026년 기준)

2026.06.11 - [인사회계 실무가이드] - [소기업 퇴사자 처리 ⑧] 4대보험 상실신고 방법 및 고용보험 이직확인서 (2026년 기준)